1924年1月，毛泽东到广州，代表湖南国民党组织，出席国民党第一次全国代表大会。毛被指定为章程审查委员之一，并当选为国民党中央候补执行委员。大会闭幕后，国民党成立了中央党部，派遣中央执行委员分赴上海、北京、汉口，组织执行部，指导和监督党务工作。

1924年2月中旬，毛被派往上海，帮助国民党做组织工作，上海执行部由胡汉民、汪精卫和叶楚伧，组成常务委员会，实际负责人是组织部长胡汉民。毛作胡汉民秘书，协助办理事务，月薪120银元，也是共产党员加入国民党，在国民党做事的重要举措。这样，毛就有了双秘书的身份。毛同时是中共组织部长，陈独秀秘书。

1924年7月，毛辞去国民党组织部秘书，推荐共产党员张廷灏继任。1924年8月，国民党上海负责人叶楚伧（胡汉民、汪精卫常在广州）用尽办法把毛赶走，毛在与叶的斗争中处于下风。张国焘和李立三还嘲讽他，说他给国民党做工作，是胡汉民的秘书。

那时，毛看不出国民党与共产党，有什么区别。国民党也是革命党，而且人多势众，接受俄国援助，比共产党多得多。毛认为，共产国际应接受国民党，成为一个支部。莫斯科代表达林（Sergei Dalin）对毛不满，批评他右倾，要求中央局换人，“四大”代表没有毛，他不得不走人。

1924年12月，毛被迫以请病假为名避风，回湖南休养，在韶山老家一待就是8个月。在长沙为共产党工作的两个弟弟，都回来作帮手。长沙共产党人组织罢工，游行示威，毛没去参加，很多时间在家打牌。国民党主要纲领是“打倒帝国主义”，围绕这个主题，跟农民的生活没什么关系，农民没什么兴趣。毛曾跟同道走了一村又一村集合人来开会，找农民开会很费力，成效谈不上，毛召集农民开会，往往到会人只有一两个，会开不成。

毛没有组织过反对富人的农民运动。毛曾在1924年1月18日对鲍罗廷说，这类斗争必然失败。有的地方共产党组织不识字的农民，领导他们同富裕地主进行斗争。结果党组织立刻遭到破坏，被查封。这些农民不仅不认为他们是为自己的利益而斗争，甚至还仇视他们。农民们说：“如果不把我们组织起来，就不会发生任何灾难。

农民从心里不相信共产党。当时共产党在长沙领导由五卅运动引起的反帝大游行。耶鲁大学办的湘雅医学院院长，给美国驻长沙领事馆的报告说：“湖南省长接到一张20个鼓动领导人的名单，其中有毛泽东，是首要的共产主义宣传者。”这是毛的名字第一次出现在美国政府的档案里。虽然毛并没有参与领导这些游行，但因为他的名气，当局也把他列入嫌疑犯。

1924年8月，省里发文要捉毛。韶山家里给毛雇了轿子，抬他去长沙避风。毛跟轿夫讲好，有人问抬的是谁，就说是医生。团防局隔了几天，才来捉毛，毛没在家，只开了些钱就了事。开慧和其他家人都没有受伤害。